麻省理工学院微流控术同时精确测量多个细胞体重
最近,美国麻省理工学院(MIT)发明的一种新技术,可以同时精确地测量许多单细胞的生长。这一进展有望带来快速的药物测试,对“更大细胞群体中单个细胞之间的生长差异”提供了新的见解,并有助于跟踪不断变化的环境条件下的细胞动态生长。这一技术发表在《Nature Biotechnology》杂志。
这种技术利用大量的悬浮微孔道谐振器(SMR)——一种微流控装置,可测量流经微孔道的大多数细胞。一种新的设计使该设备的通量增加了近两个数量级,同时保持精确度。2012年,他们在之前研发的一个微流控设备(暂停通道谐振器SMR,用来检测细胞的重量)的基础上,进行了大规模改动,将其用于细胞周期检测,可以分析单个细胞在经过100小时生长后多代的情况。在今年1月份,他们通过将复杂的RNA测序技术与分离单个细胞及其后代的新装置相结合,可追踪来自一个“祖先”的几代细胞的详细谱系。相关研究结果发表在《Nature Communications》。
在这项新的研究中,研究人员使用该设备来观察抗生素和抗菌肽对细菌的影响,并指出细胞群体中单个细胞的生长变化,这具有重要的临床应用价值。例如,生长较慢的细菌有时会对抗生素产生耐药性,并可能导致复发性的感染。
麻省理工学院生物工程和机械工程系教授Manalis表示:“该设备对于细胞如何生长并对药物产生反应,提供了新的见解。”该论文的第一作者是Nathan Cermak——最近从麻省理工学院计算和系统生物学项目毕业的博士生,和Selim Olcum——Koch研究所的科学家。其他13名共同作者来自于Koch研究所、MIT微系统技术实验室、Dana-Farber癌症研究所、Innovative Micro Technology和CEA LETI。
Manalis和他的同事们在2007年首次开发了SMR,后来推出了多种创新用于不同的目的,包括随时间的推移跟踪单个细胞的生长、测量细胞密度、称量细胞分泌的囊泡,就在最近,测量不断变化的营养条件下细胞的短期生长反应。
所有这些技术都依赖于一个关键的方案:一条充满液体的微通道,被蚀刻在一个微小的硅悬臂梁传感器上,它在一个真空腔中震动。当一个细胞进入悬臂梁时,它会稍微改变传感器的振动频率,这个信号可以用来确定细胞的重量。它们就像称重站,当每个细胞流经这个邮票大小的设备时,它会记录每个细胞的质量。在每个传感器之间是弯曲的“延迟通道”,每一个长度约五厘米,细胞流经它的时间约为两分钟,从而使它们在到达下一个传感器之前有时间生长。当一个细胞退出一个传感器时,另一个细胞可以进入,从而增加了设备的吞吐量。这些结果显示了每个传感器上的每一个细胞的质量,将它们生长或缩小的程度用图形绘制出来。
传统的抗生素测试需要培养细菌,这可能需要一天或更多的时间。使用这种新的设备,在一个小时内,研究人员就能记录下细胞积累质量的变化率。记录时间减少,是测试药物对抗临床细菌感染的关键,Manalis说:“在某些情况下,有一个快速检测法用于选择抗生素,可使患者生存率带来重大的变化。”
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