微流控到底如何用于菌群研究

Biomicrofluidics：菌群研究中可用的微流控技术（综述）

① 微流控技术通过微流控芯片和细胞捕获实现对微生物单个细胞的追踪观察，是微生物研究中的新方法；

② 现有的微流控（芯片）装置可以分为连续流动装置、微液滴装置、（试）纸装置和数字微流控装置等四类；

③ 使用流体陷阱、微孔播种、电势陷阱、微液滴包装和光学陷阱等方法捕获单细胞，从而在单细胞层面实现追踪和持续监测；

④ 结合微流控可以实现单细胞水平上的基因测序、表达谱分析、代谢分析和疾病筛查等，具有十分光明的应用前景。

Microfluidics: A new tool for microbial single cell analyses in human microbiome studies

2017-12-13  DOI: 10.1063/1.5002681

TP：氯胺酮的抗抑郁效果或与肠-脑轴相关

① 2000年，Berman等报道一定剂量氯胺酮可以起到抗抑郁效果，但其也有令病人产生幻觉等副作用；

② 氯胺酮包含有R型和S型，比较两种化合物对社交失败压力（CSDS）模型小鼠肠道菌群的影响及抗抑郁效果；

③ CSDS小鼠的柔膜菌门及放线菌门的水平发生变化；

④ 两种氯胺酮可抑制CSDS小鼠δ变形菌纲的增长，但仅有R型可显著抑制柔膜菌纲的减少；

⑤ 这可以解释为什么R型氯胺酮抗抑郁效果更好，且副作用小。

Possible role of the gut microbiota-brain axis in the antidepressant effects of (R)-ketamine in a social defeat stress model

2017-12-18  DOI: 10.1038/s41398-017-0031-4

NC：肠道活泼瘤胃球菌如何识别唾液酸？

① 活泼瘤胃球菌是典型的人体肠道共生菌，利用反式唾液酸酶降解黏液蛋白，该酶具有唾液酸特异的糖结合蛋白（RgCBM40）;

② RgCBM40有CBM40蛋白亚家族典型的β-三明治夹层结构，特异结合α2,3或α2,6-唾液酸乳糖苷，特异性识别具有广谱性；

③ RgCBM40可与杯状细胞分泌的粘液以及纯化的黏液蛋白结合，可视为新的黏附素，其结构广泛分布于厚壁菌门；

④ 活泼瘤胃球菌以唾液酸为媒介，与肠粘液结合；

⑤ 为研究共生菌在肠道定殖与分布提供了新信息。

Unravelling the specificity and mechanism of sialic acid recognition by the gut symbiont Ruminococcus gnavus

2017-12-19  DOI: 10.1038/s41467-017-02109-8

Gut：设计PPI治疗方案，多考虑点

① 幽门螺旋杆菌阳性患者长期接受质子泵抑制剂（PPI）治疗会促进特殊腺体流失而导致萎缩性胃炎，故建议先根除幽门螺杆菌；

② 153（0.24%）名进行幽门螺旋杆菌根除治疗后的患者，在PPI治疗后，中位7.6年间患上胃癌；

③ PPI治疗设计时，要考虑患者初始胃部状况如萎缩性胃炎和肠上皮化生等，以及不同PPI（如奥美拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑等）在抑酸强度上的差异，强烈抑酸作用使萎缩性胃炎恶化；

④ 还应考虑饮食习惯和癌症家族史等其他危险因素。

Several aspects in study design need further consideration

2017-12-19  DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315692

Nutrients：体外利用粪菌发酵不同益生元

① 在粪便菌群体外发酵系统中，比较5种常见膳食纤维（β-葡聚糖、商业化β-葡聚糖Oatwell、低聚木糖、菊粉、包含菊粉/果胶/纤维素/半纤维素的商品化益生元WholeFiber）的益生元效应；

② 发酵12h后，OatWell产生最多的丙酸盐，与β-葡聚糖的效应相似；

③ 发酵24h后，低聚木糖显著增加双歧杆菌属；

④ 菊粉及WholeFiber可增加有益菌属Collinsella，与之前的临床研究结果一致；⑤ 所有益生元均可促进有益短链脂肪酸的形成。

Prebiotic Dietary Fiber and Gut Health: Comparing the in Vitro Fermentations of Beta-Glucan, Inulin and Xylooligosaccharide

2017-12-15  DOI: 10.3390/nu9121361

JFF：苦瓜调节肥胖大鼠肠道菌群并改善代谢

① 苦瓜富含膳食纤维和其他生物活性化合物，给肥胖大鼠喂食高脂饮食（HFD）并用苦瓜粉（BMP）处理8周；

② 与HFD组相比，BMP有效延缓体重增加和提高胰岛素敏感性，降低内毒素负荷；

③ BMP改变了肠道菌群，尤其是劳特氏菌属和Allobaculum属的丰度，也改变了代谢谱，包括有机酸、氨基酸和糖类的代谢；

④ 属水平的特定肠道菌群与有效生物标志物之间有显著的相关性；

⑤ 在肥胖小鼠中，BMP通过恢复肠道菌群和肠道代谢产物发挥抑制胰岛素抵抗和抗炎作用。

Modulation of gut microbiota and gut-generated metabolites by bitter melon results in improvement in the metabolic status in high fat diet-induced obese rats

2017-12-22  DOI: 10.1016/j.jff.2017.12.050

JAM：饲料中添加中药可显著改善银鲫的肠道菌群

① 研究具有抗炎和免疫活性的玉屏风散（防风、黄芪和白术）作为中药饲料添加剂对异育银鲫肠道菌群的影响；

② 中药可增加异育银鲫的菌群丰度、多样性以及均匀性，在门水平上，变形杆菌门、放线菌门、 酸杆菌门数量显著增加，梭杆菌门数量显著降低；

③ 在属水平上，潜在的病原体如发病气单胞菌、 鲍曼不动杆菌和希瓦氏菌水平降低，潜在的益生菌如乳杆菌、 乳酸乳球菌、芽孢杆菌和假单胞菌水平升高；④ 为中药在水产养殖方面应用提供依据。

Significant improvement of intestinal microbiota of gibel carp (Carassius auratus gibelio) after traditional Chinese medicine feeding

2017-12-18  DOI: 10.1111/jam.13674

Aquaculture：虹鳟鱼吃点大蒜，长得块菌群也显独特

① 240条健康虹鳟鱼分为4组，分别在饲料中添加0、1%、1.5%、2%的大蒜提取物，持续120天；

② 相比于对照组，补充了大蒜的虹鳟鱼的体重增加及比生长速率显著升高；

③ 对肠黏膜菌群进行分析发现，对照组虹鳟鱼中丰度最高的是Deefgea菌属及气单胞菌属；

④ 饲料中大蒜含量为1%及1.5%的虹鳟鱼中，肠道菌群丰度最高的是Deefgea菌属及支原体属；

⑤ 饲料中大蒜含量为2%的虹鳟鱼中，肠道菌群丰度最高的是气单胞菌属。

Effects of garlic-supplemented diet on growth performance and intestinal microbiota of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

2017-12-17  DOI: 10.1016/j.aquaculture.2017.12.022

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