微流控芯片蛋白分析技术包括：预处理技术、分离技术、检测技术等。
预处理技术有：酶解、富集、衍生、纯化。
分离技术有：区带电泳、凝胶筛分、等电聚焦、二维电泳。
检测技术有：紫外吸收、激光诱导荧光、电化学、质谱。
微流控芯片在蛋白质研究中的应用有：性质鉴定（分子质量测定、等电点测定）、结构分析（氨基酸序列分析、构象分析、蛋白质结晶）、功能研究（糖基化、磷酸化、相互作用研究）、实际样品分析（细胞内蛋白质表达、临床样品分析）等。
微流控芯片蛋白分析技术整体框架图解如下：
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